Gran parte del territorio de la Provincia San Juan se encuentra dentro del valle con el mismo nombre, formado en medio de la Cordillera Central y la Sierra de Neiba. El Valle de San Juan posee una extensión territorial de 100 kilometros de largo por 20 de ancho y en su interior se encuentran algunos de los suelos mas productivos del Pais.
En la parte de la Cordillera Crentral que forma parte de la provincia San Juan se encuentran las montañas más altas del pais y de toda la región del Caribe: El Pico Duarte, de3,175 metros sobre el nivel del mar; La Pelona, 3,168 metros; y el Pico Yaque, de 2,995 metros. En la vertiente de la Sierra de Neiba, las mayores alturas dentro del territorio sanjuanero son: El Aguacate, de 1,692 metros sobre el nivel del mar; Loma del Ajiaco, 1,562 metros; y El Pinarito, 1,535 metros.
San Juan posee una riqueza biologica y mineral incalculable, así como tambien impresionantes paisajes naturales y rios importantes del pais, esto mejora las condiciones de vida y de trabajo de sus poblaciones considerablemente.
Por estas y otras razones el Senado de la Republica Dominicana declaró a San Juan como provincia Eco-turistica. Dada esa condición, en el territorio tienen lugar diferentes acciones turisticas centradas en la protección y desarrollo de la ecologia.